En caso de accidente escolar los alumnos cuentan con el seguro entregado por Mineduc, que se denomina CAE; dicho seguro es entregado por el colegio (inspectoría general) en caso de lesiones que ocurran tanto en el Colegio Quinto Centenario como en su trayecto.
Este seguro permite al alumno accidentado ser atendido en cualquier centro de la red pública de salud, en el área de seguro escolar.